Il a succédé à Aymeric Bonnemaison le 1er août 2025, quittant son poste de numéro 2 de l'Anssi.

Le ComCyber (Commandement de cyberdéfense) du ministère des Armées françaises a officialisé, le 9 août 2025, la nomination à sa tête d’Emmanuel Naëgelen, effective depuis le 1er août 2025. Directeur adjoint de l’Anssi depuis 2021, ce militaire de carrière succède à Aymeric Bonnemaison, en poste depuis 2022.

Emmanuel Naëgelen avait déjà travaillé pour le ComCyber entre 2019 et 2021, comme directeur du pôle Opérations. Il avait ensuite rejoint l’Anssi en tant que conseiller du directeur de l’époque, Guillaume Poupard, avant d’être promu numéro 2 de l’agence six mois plus tard.

Il revient donc au ComCyber pour en prendre le commandement. Promu pour l’occasion au grade de général de division, Emmanuel Naëgelen dirigera les 3 600 cybercombattants, civils et militaires, qui en assurent les missions.

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